Consultant - Bioinformatique protéomique H/F

Vous avez un parcours solide en bioinformatique, une expertise confirmée dans le traitement et l’analyse de données protéomiques, et souhaitez intégrer une structure dynamique au cœur de l’innovation en Life Sciences ? Rejoignez-nous ! Poste basé à Lyon (possibilité de télétravail).

Vos Missions:

Récupération et vérification de génome ou protéome en identifiant et caractérisant les gènes d'intérêt et leurs fonctions biologiques notamment en lien avec l’identification d’HCP (Host Cell Protein).

Migration, maintenance et modernisation des infrastructures de données (notamment les bases de données Mascot).

Support dans la réalisation et l’automatisation d’analyse de données de spectrométrie de masse.

Support pour faciliter la génération de fragments d’anticorps (FAb) et la sélection de candidats.

Interface technique privilégiée avec les autres départements au sein du laboratoire pour les différents projets tout en facilitant le partage des résultats entre les équipes.

Mise en place et gestion d’un espace dédié des informations en liens avec les bioinformaticiens du département des Sciences Analytiques.

Assurer une veille technologique sur les nouvelles approches et outils bioinformatiques.

Environnement Techniques et Applications

Logiciels de détection et quantification des spectres peptidiques (MASCOT, Skyline, Proteome Discoverer, PEAKS)

Outils d’analyse de séquence (Ugene, CLCGenomicsWorkbench, Geneious)

Manipulation de séquences (Seqkit, MMseqs, BLAST) et d’alignement multiple de séquences (mafft, clustal)

Visualisation de structures 3D (PyMOL, Chimera/ChimeraX)

Outils d’identification d’épitopes et paratopes (SCALOP, Discotope, FreeSASA, ElliPro)

Connaissances de bases de données spécialisées (UniProt, PDBbind, PDB, OAS, SAbDab, GISAID, IEDB)

Maîtrise des langages R ou Python pour l'analyse de données.

Profil recherché

Formation : Master 2 ou Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, data science appliquée à la santé ou équivalent.

Expérience : Minimum 2 ans en analyse de données protéomiques ou en tant que bioinformaticien/ne en environnement industriel ou académique.

Maîtrise des langages de programmation : Python, R (avec une expérience pratique de packages bioinformatiques tels que Bioconductor, Pandas, SciPy).

Connaissance des environnements Linux/Unix et de l’utilisation de plateformes HPC / cloud (AWS, Azure, GCP) appréciée.

Expérience sur l’analyse de données issues du

#J-18808-Ljbffr